企業(yè)認定條件：
深圳市重點軟件企業(yè)是指經我市軟件產業(yè)主管部門會同相關部門認定，從事具有自主知識產權的軟件產品研發(fā)、銷售，且符合下列條件之一的軟件企業(yè)：
（一）以從事儀器設備銷售，且儀器設備中含自主研發(fā)的嵌入式軟件類的企業(yè)：已經實現(xiàn)的軟件年銷售收入不低于1億元人民幣，其中不能單獨銷售的嵌入式軟件銷售收入以嵌入式產品銷售收入的35%計，年納稅額（包括在我市國稅和地稅部門繳納的各種稅款，下同）不低于500萬元人民幣且年納稅額與軟件年銷售收入比不低于2%；
（二）以委托進行軟件開發(fā)或從事系統(tǒng)集成為主業(yè)類的企業(yè)：具有自主知識產權的軟件及軟件服務，系統(tǒng)集成軟件收入不低于5000萬元人民幣，其中自行開發(fā)且未單獨銷售的系統(tǒng)集成軟件收入以系統(tǒng)集成總收入的35%計，年納稅額不低于200萬元人民幣且年納稅額與軟件年銷售收入比不低于2%；
（三）以銷售自主開發(fā)的套裝軟件類企業(yè)：純軟件年銷售收入不低于2000萬元人民幣，純軟件企業(yè)是指年銷售收入的80%為軟件收入，年納稅額不低于80萬元人民幣且年納稅額與軟件年銷售收入比不低于2%；
（四）以承接出口軟件外包服務或軟件出口為主業(yè)類企業(yè)，軟件年收入不低于100萬美元，且軟件出口占本企業(yè)年銷售收入的35%以上；
（五）符合深圳市軟件產業(yè)發(fā)展規(guī)劃要求的軟件重點領域銷售收入列全市前二位，年軟件銷售收入在2000萬元以上，年納稅額不低于80萬元人民幣且年納稅額與軟件年銷售收入比不低于2%的企業(yè)。重點領域依據(jù)當年主管部門結合產業(yè)發(fā)展現(xiàn)狀所確定的目錄為準。
以上數(shù)據(jù)必須與企業(yè)提交的軟件產業(yè)統(tǒng)計年報及經審核后的審計報告相一致。
申請材料：
（一）《深圳市重點軟件企業(yè)認定申報表》；
（三）軟件企業(yè)認定證書復印件；
（四）企業(yè)法人營業(yè)執(zhí)照副本及復印件；
（五）自主開發(fā)或擁有知識產權的軟件產品的證明材料（產品登記證書、著作權登記證書或專利證書等）復印件；
（六）經注冊會計事務所審計的本企業(yè)2013年度財務審計報告，包括資產負債表，損益表，現(xiàn)金流量表，企業(yè)所得稅納稅申報表，企業(yè)所得稅完稅證明，企業(yè)增值稅完稅證明；
（七）經注冊會計事務所審計的本企業(yè)2013年度軟件業(yè)務收入及研發(fā)費用、技術人員等情況專項審計報告，人員社保清單及學歷構成；軟件開發(fā)環(huán)境和企業(yè)經營情況等有關內容；
（八）軟件企業(yè)出口總額的證明材料、結匯單；
（九）企業(yè)所得稅納稅申報表、企業(yè)所得稅完稅證明、企業(yè)增值稅完稅證明、人員社保清單以及領導層學歷構成；
（十）上一年度銷售額排名前五位的合同的首尾頁、合同金額頁；
（十一）獲得國家級、部級獎勵的證書復印件及附件；
（十二）系統(tǒng)集成企業(yè)的資質等級證明材料及復印件；
（十三）產品占有市場的資料及附件。
認定程序：
（一）深圳市科技和信息局每年一次受理軟件企業(yè)的申請，會同市財政局、發(fā)展和改革局、貿易工業(yè)局、國家稅務局、地方稅務局、高新技術產業(yè)園區(qū)領導小組辦公室及市軟件行業(yè)協(xié)會對軟件企業(yè)上報材料進行初審；
（二）深圳市科技和信息局會同上述單位對初審合格的企業(yè)進行現(xiàn)場考察；
（三）現(xiàn)場考察通過后，由深圳市科技和信息局會同上述單位組織專家小組進行評審；
（四）專家小組評審通過后，由深圳市科技和信息局會同上述單位核準并公示通過名單；
（五）公示無異議的企業(yè)，由深圳市科技和信息局會同市財政局、發(fā)展和改革局、貿易工業(yè)局、國家稅務局、地方稅務局、高新技術產業(yè)園區(qū)領導小組辦公室聯(lián)合發(fā)文，認定為市重點軟件企業(yè)，并由深圳市科技和信息局向其頒發(fā)認定證書。
證書有效期：
深圳市重點軟件企業(yè)實行一年一申報制度。認定有效期為一年。
享受稅收優(yōu)惠：
1、自2000年 6月24日起至2010年底以前，對增值稅一般納稅人銷售其自行開發(fā)生產的軟件產品，其增值稅實際稅負超過3％享受即征即退政策部分的所退稅款，用于企業(yè)研究開發(fā)軟件產品和擴大再生產，不作為企業(yè)所得稅應稅收入，不征收企業(yè)所得稅。
2、對我國境內新辦的軟件生產企業(yè)經認定后，自獲利年度起，第一年和第二年免征企業(yè)所得稅，第三年至第五年減半征收企業(yè)所得稅。
3、對國家規(guī)劃布局內的重點軟件生產企業(yè)，如當年未享受免稅優(yōu)惠的，減按10％的稅率征收企業(yè)所得稅。
4、軟件生產企業(yè)的工資和培訓費用，可按實際發(fā)生額在計算應納稅所得額時扣除。
5、企事業(yè)單位購進軟件，凡購置成本達到固定資產標準或構成無形資產，可以按照固定資產或無形資產進行核算。經主管稅務機關核準，其折舊或攤銷年限可以適當縮短，最短可為2年。